2014年8月16日、中國江蘇網は記事「ナイジェリア、エボラ熱の影響で南京ユースオリンピックを出場辭退」を掲載した。

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國際オリンピック委員會（IOC）は、エボラ熱の影響を受け、ナイジェリア政府は南京ユースオリンピックの不參加を決めたことを発表した。シエラレオネ、リベリアに続く3カ國目の出場辭退となった。すでに現地に滯在していたアスリートの帰國も決定された。IOCのトーマス?バッハ會長は「辭退の決定は各選手の意思に委ねるべきで、IOCはいかなる國の參加も拒否していない。ただし同時に各國政府の決定を尊重しなければならない」とコメントした。

またエボラ熱対策として感染地域の3選手を格闘競技、水泳から除外する異例の措置も導入された。ただしユースオリンピックから完全に除外されるわけではなく、開會式には感染地域の選手も旗手として參加している。また影響を受けた選手については將來的に特別な競技機會を與えるべく南京市にもう一度招きたいとバッハ會長は話している。（翻訳?編集/KT）